The amount of the special land holding tax is the amount specified in each of the following items according to the classification listed in that item:
特別土地保有税の税額は、次の各号に掲げる区分に応じ、当該各号に定める額とする。
The special land holding tax under Article 599, paragraph (1), item (i): the amount obtained by deducting, from the amount obtained by multiplying the tax base amount under paragraph (2), item (i) of that Article by the tax rate under Article 594, the total of the amounts obtained by multiplying by 1.4 percent the price that is to be the tax base of the fixed assets tax for that fiscal year to be imposed by the municipality under Articles 342 and 343 on the land set forth in that item, up to the limit of the former amount
The special land holding tax under Article 599, paragraph (1), item (ii) or (iii): in each case, the amount obtained by deducting, from the amount obtained by multiplying the tax base amount under Article 599, paragraph (2), item (ii) or (iii) by the tax rate under Article 594, the total of the amounts obtained by multiplying by 4 percent the price that is to be the tax base of the real property acquisition tax to be imposed by the prefecture under Article 73-2 on the acquisition of the land set forth in Article 599, paragraph (2), item (ii) or (iii) (where the amount of that real property acquisition tax has not been finalized by the date listed in Article 599, paragraph (1), item (ii) or (iii), or where Article 585, paragraph (6) applies, the amount specified by Cabinet Order as the price that is to be the tax base of that real property acquisition tax), up to the limit of the former amount
第五百九十九条第一項第二号又は第三号の特別土地保有税 それぞれ、同条第二項第二号又は第三号の課税標準額に第五百九十四条の税率を乗じて得た額から、当該額を限度として、同項第二号又は第三号の土地の取得に対して第七十三条の二の規定により道府県が課すべき不動産取得税の課税標準となるべき価格（第五百九十九条第一項第二号若しくは第三号に掲げる日までに当該不動産取得税の額が確定していない場合又は第五百八十五条第六項の規定の適用がある場合には、当該不動産取得税の課税標準となるべき価格として政令で定める額）に百分の四を乗じて得た額の合計額を控除した額
定義第三百四十九条の三第九項
土地又は家屋にあつては、土地課税台帳等若しくは家屋課税台帳等に登録された基準年度に係る賦課期日における価格又は第三百四十九条第二項ただし書、第三項ただし書、第四項、第五項ただし書若しくは第六項の規定により当該価格に比準するものとされる価格をいい、償却資産にあつては、償却資産課税台帳に登録された賦課期日における価格
わかりやすく言うと
固定資産税の課税標準となるべき価格で、土地・家屋は土地課税台帳等や家屋課税台帳等に登録された基準年度の賦課期日の価格（第三百四十九条第二項ただし書などで比準する価格を含みます）、償却資産は償却資産課税台帳に登録された賦課期日の価格のことです。
略称規定第五百八十五条第三項・この節の中だけ
この節の規定中土地に対して課する特別土地保有税に関する規定は、第一項の土地（以下この節において「土地」という。）の所有者が所有する土地で第五百九十九条第一項の規定により申告納付すべき日の属する年の一月一日において当該土地の取得をした日以後…
わかりやすく言うと
田、畑、宅地、塩田、鉱泉地、池沼、山林、牧場、原野その他の土地のことです（第五百八十五条第二項）。特別土地保有税は、この土地やその取得に対して課されます。