第三条（非課税とされる通勤手当に関する経過措置）
Supplementary Provisions, Article 3Transitional Measures Concerning Commutation Allowances Treated as Nontaxable
The provisions of Article 20-2 (Commutation Allowances Treated as Nontaxable) of the New Order apply to commutation allowances prescribed in that Article that are to be received on or after the date of enforcement of this Cabinet Order (hereinafter referred to as the "Effective Date") (excluding those that are additionally paid as the difference in those commutation allowances that were to be received before the Effective Date), and the provisions then in force continue to govern commutation allowances prescribed in Article 20-2 (Commutation Allowances Treated as Nontaxable) of the Order for Enforcement of the Income Tax Act prior to amendment (hereinafter referred to as the "Former Order") that were to be received before the Effective Date (including commutation allowances that are to be received on or after the Effective Date and are additionally paid as the difference in those commutation allowances that were to be received before the Effective Date).
略称規定附則第二条第一項
別段の定めがあるものを除き、改正後の所得税法施行令（以下「新令」という。）の規定は、平成十六年分以後の所得税について適用し、平成十五年分以前の所得税については、なお従前の例による。
わかりやすく言うと
平成十六年政令第百号によって改正された後の所得税法施行令のことです。
略称規定附則第三条第一項
新令第二十条の二（非課税とされる通勤手当）の規定は、この政令の施行の日（以下「施行日」という。）以後に受けるべき同条に規定する通勤手当（施行日前に受けるべき当該通勤手当の差額として追給されるものを除く。）について適用し…
わかりやすく言うと
この附則が属する改正政令（平成十六年政令第百号）が施行される日のことです。
略称規定附則第三条第一項
…この政令の施行の日（以下「施行日」という。）以後に受けるべき同条に規定する通勤手当（施行日前に受けるべき当該通勤手当の差額として追給されるものを除く。）について適用し、施行日前に受けるべき改正前の所得税法施行令（以下「旧令」という。）第…
わかりやすく言うと
平成十六年政令第百号によって改正される前の所得税法施行令のことです。