Where the amount of interest on refund is calculated for a refund under the provisions of Article 139, paragraph (1) (Refunding of Prepaid Taxes) of the Act, the provisions of Article 139, paragraph (3) of the Act are applied, treating as the prepaid taxes to be refunded prescribed in that paragraph each of the tax prepayment, etc. obtained by going back sequentially, in the order specified in the following items, until reaching the amount of that refund (where that refund is used to make the Appropriation under paragraph (2), item (i) or (ii) of the preceding Article, the amount obtained by deducting the amount of the refund used for that Appropriation), out of the tax prepayment, etc. prescribed in paragraph (1), item (i) of the preceding Article for the year pertaining to the Tax Return prescribed in Article 139, paragraph (1) of the Act (excluding, where there is an amount that has already been made the basis for calculating the amount of interest on refund under Article 139, paragraph (3) or Article 160, paragraph (3) (Refunding of Prepaid Taxes Based on Reassessment or Similar Decision) of the Act, or an amount to be appropriated by a refund under Article 139, paragraph (1) or Article 160, paragraph (1) of the Act, those amounts; hereinafter in this Article referred to as "tax prepayment, etc.").
法第百三十九条第一項（予納税額の還付）の規定による還付金について還付加算金の額を計算する場合には、同項に規定する確定申告書に係る年分の前条第一項第一号に規定する予定納税額等（既に法第百三十九条第三項若しくは第百六十条第三項（更正等による予納税額の還付）の還付加算金の額の計算の基礎とされた部分の金額があり、又は法第百三十九条第一項若しくは第百六十条第一項の規定による還付金をもつて充当をされる部分の金額がある場合には、これらの金額を除く。以下この条において「予定納税額等」という。）のうち次に定める順序により当該還付金の額（当該還付金をもつて前条第二項第一号又は第二号の充当をする場合には、当該充当をする還付金の額を控除した金額）に達するまで順次遡つて求めた各予定納税額等を法第百三十九条第三項に規定する還付をすべき予納税額として、同項の規定を適用する。
among the tax prepayment, etc., for those with different statutory payment due dates prescribed in Article 2, item (viii) (Definitions) of the Act on General Rules for National Taxes (hereinafter in this Article referred to as "statutory payment due date"), the one with the later statutory payment due date takes priority;
当該予定納税額等のうち国税通則法第二条第八号（定義）に規定する法定納期限（以下この条において「法定納期限」という。）を異にするものについては、その法定納期限の遅いものを先順位とする。
among the tax prepayment, etc. with the same statutory payment due date, for those with different dates of finalization, the one with the later date of finalization takes priority;
among the tax prepayment, etc. with the same statutory payment due date and date of finalization, for those with different dates of payment, the one with the later date of payment takes priority.
定義第一条第一項
それぞれ所得税法（以下「法」という。）第二条第一項（定義）に規定する国内、国外、居住者、非永住者、非居住者、内国法人、外国法人、人格のない社団等、株主等、法人課税信託、恒久的施設、公社債、預貯金、合同運用信託、貸付信託、投資信託、証券投資信託、オープン型の証券投資信託、公社債投資信託、公社債等運用投資信託、公募公社債等運用投資信託、特定目的信託、特定受益証券発行信託、棚卸資産、有価証券、固定資産、減価償却資産、繰延資産、各種所得、各種所得の金額、変動所得、臨時所得、純損失の金額、雑損失の金額、災害、障害者、特別障害者、寡婦、ひとり親、勤労学生、同一生計配偶者、控除対象配偶者、源泉控除対象配偶者、扶養親族、控除対象扶養親族、源泉控除対象親族、特別農業所得者、予定納税額、確定申告書、期限後申告書、修正申告書、青色申告書、更正請求書、確定申告期限、出国、更正、決定、源泉徴収、附帯税、充当又は還付加算金
わかりやすく言うと
税務署長などが国税の還付金等を還付し、又は充当する場合に、その金額に加えられる金額で、一定の日の翌日から支払決定の日又は充当の日までの日数に応じて計算されるものです（国税通則法第五十八条第一項）。
略称規定第二百六十八条第一項第一号・この条の中だけ
その年分の未納の所得税で修正申告書の提出又は更正により納付すべきもの（法第百二十条第二項各号（予納税額の意義）に掲げる税額（以下この条において「予定納税額等」という。）を除く。）があるときは、当該所得税に充当する。
わかりやすく言うと
その年分の予定納税額と、年の途中で出国する場合の確定申告によって納付した又は納付すべき所得税の額のことです（所得税法第百二十条第二項各号）。
略称規定第二百六十九条第一項・この条の中だけ
法第百三十九条第一項（予納税額の還付）の規定による還付金について還付加算金の額を計算する場合には、同項に規定する確定申告書に係る年分の前条第一項第一号に規定する予定納税額等（既に法第百三十九条第三項若しくは第百六十条第三項（更正等による予…
わかりやすく言うと
確定申告書に係る年分の予定納税額と、年の途中で出国する場合の確定申告によって納付した又は納付すべき所得税の額のうち、すでに還付加算金の計算のもとにされた部分や、還付金で充当される部分を除いたもののことです。
略称規定第二百六十九条第一項第一号・この条の中だけ
当該予定納税額等のうち国税通則法第二条第八号（定義）に規定する法定納期限（以下この条において「法定納期限」という。）を異にするものについては、その法定納期限の遅いものを先順位とする。
わかりやすく言うと
国税に関する法律の規定によって国税を納付すべき期限のことで、一部の国税は別に定める期限又は日によります。繰上請求による期限や、延納、納税の猶予などに係る期限は含みません（国税通則法第二条第八号）。